Wat leer je?

In deze cursus leer je de basis van superrekenen. De dag begint met een inleiding over supercomputerarchitectuur, inclusief een hands-on sessie gericht op het uitvoeren van taken op een supercomputer.

De tweede helft van het programma richt zich op het vertalen van je R workflow van een GUI (Rstudio) workflow op je desktop naar een scripting/batch omgeving op de supercomputer. Onderwerpen die aan bod komen zijn onder andere: efficiënt programmeren, parallel computing en het gebruik van de SLURM job manager om je job/analyse naar de supercomputer te sturen.

In deze cursus zul je:

• Doe praktische oefeningen om te leren hoe je de nationale supercomputer Snellius effectief kunt gebruiken en hoe je je taken met minimale inspanning in de kortst mogelijke tijd kunt voltooien.
• Ervaar hoe je hoge prestaties kunt bereiken met R door gebruik te maken van de supercomputingfaciliteiten van SURF

Vereisten:

• Basiskennis van Linux (Unix-shell) is handig
• Basiskennis van R is nuttig

Je moet beschikken over:

Een eigen laptop met een up-to-date browser en een terminal emulator (Putty is prima voor gebruikers van de OSSC/CBS RA-omgeving). Het gebruik van de besturingssystemen Linux en macOS heeft de voorkeur maar is niet verplicht. Windows-gebruikers raden we aan MobaXterm (draagbare versie) te downloaden als terminalemulator. Als je beperkt bent in je keuze, werkt Putty ook.

Kosten

Deelname is gratis

De voertaal is Engels